45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4196 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  42.32 
 
 
289 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.25 
 
 
290 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  37 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  34.43 
 
 
287 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
323 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  34.86 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.87 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.71 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  31.36 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.52 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 
216 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.56 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
254 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.35 
 
 
212 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.34 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
348 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.61 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
204 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  29.09 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  40.21 
 
 
401 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.2 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.14 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
253 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  30 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>