More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2993 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  60 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  47.15 
 
 		 258 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.2 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  42.59 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  35.32 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  33.48 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  35.27 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.54 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  32.51 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  34.11 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.4 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.14 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.14 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  40 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.26 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.31 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.31 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  37.21 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.52 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.74 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.95 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.04 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  35.45 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  39.23 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  31.75 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  38.39 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  33.91 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 474 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  37.21 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.39 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.1 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  33.83 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 779 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.23 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.23 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4485  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.14 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.25 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  35.25 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.07 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  26.81 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  37.5 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.8 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 		 2021 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>