More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0861 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  73.44 
 
 		 195 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 187 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  39.56 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  39.88 
 
 		 186 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4101  methyltransferase type 11  41.76 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0157536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.58 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.6 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.48 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  32.58 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.83 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  34.35 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.17 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.45 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.46 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 1005 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 261 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 274 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 411 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 409 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  30.66 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  30 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  38.24 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33.65 
 
 		 292 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.07 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 274 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.27 
 
 		 251 aa  51.6  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.09 
 
 		 246 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 355 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>