More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5922 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2021 aa  3952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  50 
 
 		 3693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  50.18 
 
 		 3702 aa  473  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  50 
 
 		 3693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.53 
 
 		 1656 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  50.56 
 
 		 3176 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  48.89 
 
 		 2880 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  44.96 
 
 		 1587 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  46.83 
 
 		 3130 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  49.07 
 
 		 3676 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 		 3696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 1874 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  45.61 
 
 		 1354 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  45.08 
 
 		 2230 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  46.32 
 
 		 2232 aa  446  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 		 2551 aa  447  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  50.49 
 
 		 3679 aa  446  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  50 
 
 		 2477 aa  443  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.77 
 
 		 2762 aa  440  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  44.52 
 
 		 1822 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 1520 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 1520 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  45.68 
 
 		 1812 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.21 
 
 		 950 aa  429  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 		 1190 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 		 1190 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  47.12 
 
 		 3449 aa  429  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  49.43 
 
 		 2201 aa  429  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 		 1474 aa  430  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 		 1190 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  47.17 
 
 		 1828 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  48.21 
 
 		 1580 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 1559 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.75 
 
 		 1559 aa  427  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  48.36 
 
 		 1580 aa  427  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  48.36 
 
 		 1580 aa  427  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  44.21 
 
 		 1349 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.21 
 
 		 1349 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  42.86 
 
 		 3252 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  46.88 
 
 		 4478 aa  424  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  47.45 
 
 		 1876 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  44.34 
 
 		 1337 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.79 
 
 		 1087 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  47.36 
 
 		 1581 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  49.14 
 
 		 2546 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  48.44 
 
 		 1577 aa  421  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2365  polyketide synthase  46.06 
 
 		 1184 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.518417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  47.83 
 
 		 3427 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  47.34 
 
 		 1823 aa  417  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  48.71 
 
 		 2546 aa  417  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  49.9 
 
 		 3424 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  48.58 
 
 		 2545 aa  413  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  46.59 
 
 		 3645 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  48.9 
 
 		 2103 aa  410  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  42.42 
 
 		 3781 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  45.69 
 
 		 2507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  48.04 
 
 		 2545 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  47.84 
 
 		 2544 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  47.84 
 
 		 2544 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  44.73 
 
 		 1939 aa  406  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 3780 aa  407  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  47.91 
 
 		 1144 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  45.14 
 
 		 1304 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  42.65 
 
 		 1966 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  49.88 
 
 		 2543 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  46.17 
 
 		 2985 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  45.38 
 
 		 2188 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  49.06 
 
 		 2556 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  45.19 
 
 		 3099 aa  400  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.35 
 
 		 4080 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  47.24 
 
 		 2890 aa  400  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.22 
 
 		 1372 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  42.98 
 
 		 1805 aa  399  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  42.86 
 
 		 2225 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 1208 aa  397  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  43.69 
 
 		 1827 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 		 1974 aa  397  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  43.3 
 
 		 1832 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  44.18 
 
 		 2499 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  44.05 
 
 		 2547 aa  394  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  46.26 
 
 		 2463 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  43.66 
 
 		 1658 aa  393  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 		 2543 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5323  beta-ketoacyl synthase  44.67 
 
 		 518 aa  389  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.74 
 
 		 7110 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  49.07 
 
 		 2439 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.93 
 
 		 1867 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.04 
 
 		 1804 aa  387  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  37.77 
 
 		 3718 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  51.76 
 
 		 2220 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  45.47 
 
 		 2162 aa  383  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 		 1806 aa  384  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.68 
 
 		 2136 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.59 
 
 		 2333 aa  383  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 		 3080 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>