More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5924 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2201 aa  4336    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 		 2880 aa  593  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 		 3696 aa  583  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 		 3676 aa  560  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.47 
 
 		 4478 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 		 3679 aa  549  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3693 aa  550  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3693 aa  550  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3702 aa  550  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 		 3176 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 		 2985 aa  530  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  31.02 
 
 		 3781 aa  517  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.13 
 
 		 3930 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  33.2 
 
 		 3780 aa  509  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 		 3645 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 		 2975 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 3092 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  36.15 
 
 		 4882 aa  499  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 7279 aa  500  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.27 
 
 		 4151 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  42.11 
 
 		 3033 aa  497  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 2551 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 		 7210 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 1874 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  49.32 
 
 		 1656 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  46.48 
 
 		 1587 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  40.11 
 
 		 3045 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.63 
 
 		 3449 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  36.88 
 
 		 3158 aa  473  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 3463 aa  473  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.37 
 
 		 3670 aa  470  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.68 
 
 		 3494 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  35.3 
 
 		 3281 aa  466  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  38.98 
 
 		 3711 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  46.2 
 
 		 2232 aa  463  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 		 7110 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 		 1601 aa  459  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  39.44 
 
 		 6768 aa  457  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 		 3493 aa  457  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.25 
 
 		 3427 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.13 
 
 		 1087 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  46.23 
 
 		 1337 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  45.62 
 
 		 1349 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  40.89 
 
 		 4183 aa  450  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.62 
 
 		 1349 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  46.84 
 
 		 3130 aa  447  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 		 5255 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  36.49 
 
 		 4080 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  38.24 
 
 		 4264 aa  446  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 5400 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  32.85 
 
 		 7157 aa  444  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2365  polyketide synthase  47.54 
 
 		 1184 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.518417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  48.34 
 
 		 3424 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  45.37 
 
 		 1144 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  46.11 
 
 		 2230 aa  440  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  30.4 
 
 		 4036 aa  437  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 5154 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  44.78 
 
 		 2225 aa  437  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.56 
 
 		 1372 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5923  beta-ketoacyl synthase  41.39 
 
 		 1745 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  45.9 
 
 		 1805 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.99 
 
 		 1354 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 		 2762 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  48.75 
 
 		 1822 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  29.15 
 
 		 5854 aa  431  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 		 1559 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  52.86 
 
 		 1190 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  52.86 
 
 		 1190 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  47.68 
 
 		 1812 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.93 
 
 		 1559 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 		 5802 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.44 
 
 		 3355 aa  423  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.81 
 
 		 2966 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  42.83 
 
 		 1966 aa  424  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.62 
 
 		 950 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  52.63 
 
 		 1190 aa  424  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 		 2103 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  45.92 
 
 		 3099 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.46 
 
 		 3252 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.85 
 
 		 4930 aa  416  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  51.25 
 
 		 1520 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  46.62 
 
 		 2890 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  38.53 
 
 		 2463 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  51.25 
 
 		 1520 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  48.67 
 
 		 2188 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  30.17 
 
 		 1440 aa  414  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  32.29 
 
 		 3525 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.8 
 
 		 1804 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 		 4840 aa  410  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 		 1806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 		 1939 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  32.14 
 
 		 2727 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  46.69 
 
 		 1827 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  49.09 
 
 		 2439 aa  406  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  31.42 
 
 		 1696 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  35.66 
 
 		 7149 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  37.5 
 
 		 3408 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  48.75 
 
 		 2021 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  27.37 
 
 		 2725 aa  403  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.87 
 
 		 2136 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>