More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5923 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5923  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1745 aa  3359    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.61 
 
 		 3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.61 
 
 		 3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 		 3702 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.57 
 
 		 3679 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.81 
 
 		 3696 aa  516  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.83 
 
 		 4478 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 		 3676 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 		 2880 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 		 3645 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 		 3033 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  34.05 
 
 		 3781 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  41.57 
 
 		 2201 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  33.99 
 
 		 3780 aa  450  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 7279 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40 
 
 		 3427 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  38.78 
 
 		 3930 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 		 2975 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.98 
 
 		 4151 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 		 3176 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.91 
 
 		 3449 aa  437  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 		 3493 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  38.95 
 
 		 3281 aa  427  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 7110 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  37.55 
 
 		 3158 aa  423  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 3092 aa  423  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 		 3463 aa  416  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  37.08 
 
 		 4882 aa  417  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  39.67 
 
 		 6768 aa  413  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 5154 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 		 3711 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  38.1 
 
 		 3494 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  40.84 
 
 		 2985 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.48 
 
 		 5255 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.7 
 
 		 4080 aa  403  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  38.06 
 
 		 3355 aa  400  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.89 
 
 		 4183 aa  397  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  32.63 
 
 		 2393 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.43 
 
 		 3670 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  37.59 
 
 		 3408 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  37.98 
 
 		 3148 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.5 
 
 		 7210 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  36.98 
 
 		 7149 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 3874 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  29.91 
 
 		 7157 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.58 
 
 		 2966 aa  380  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  37.73 
 
 		 4930 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 		 2103 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  45.75 
 
 		 3099 aa  376  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  36.92 
 
 		 4264 aa  377  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 		 1656 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  30.82 
 
 		 2727 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 		 4036 aa  374  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  42.28 
 
 		 1559 aa  366  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.99 
 
 		 1087 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  28.32 
 
 		 1601 aa  364  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.07 
 
 		 1559 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  28.63 
 
 		 2725 aa  363  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 2551 aa  362  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  37.36 
 
 		 4840 aa  360  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 5400 aa  360  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  44.73 
 
 		 2890 aa  359  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.45 
 
 		 2333 aa  358  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.5 
 
 		 2136 aa  357  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 		 1874 aa  356  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  28.31 
 
 		 5854 aa  354  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.68 
 
 		 1349 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 		 1144 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  46.68 
 
 		 1349 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  45.31 
 
 		 2232 aa  353  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  44.7 
 
 		 1587 aa  350  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.88 
 
 		 1939 aa  350  9e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  46.68 
 
 		 3130 aa  350  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.82 
 
 		 3508 aa  350  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 3254 aa  347  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  31.28 
 
 		 4429 aa  347  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.88 
 
 		 3099 aa  347  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  44.38 
 
 		 3045 aa  346  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  48.27 
 
 		 2463 aa  344  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.74 
 
 		 1372 aa  343  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  42.61 
 
 		 4111 aa  343  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 2762 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 		 1354 aa  343  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  46.88 
 
 		 1304 aa  343  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  44.42 
 
 		 2230 aa  340  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.16 
 
 		 2284 aa  338  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.26 
 
 		 2847 aa  338  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  26.68 
 
 		 1440 aa  337  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  46.21 
 
 		 1114 aa  337  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.19 
 
 		 2719 aa  337  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  46.27 
 
 		 2477 aa  337  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.13 
 
 		 1909 aa  335  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 1580 aa  335  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 1580 aa  335  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  43.19 
 
 		 1580 aa  335  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2365  polyketide synthase  45.79 
 
 		 1184 aa  335  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.518417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 		 1955 aa  334  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  43.02 
 
 		 1828 aa  333  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  45.64 
 
 		 1966 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.78 
 
 		 4575 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>