More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6222 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 2551 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1304 aa  2637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6235  beta-ketoacyl synthase  54.68 
 
 		 1303 aa  1308    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 		 1587 aa  629  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 		 1354 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 1874 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 1656 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.09 
 
 		 4478 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.61 
 
 		 1087 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 		 3176 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  41.47 
 
 		 3645 aa  572  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.35 
 
 		 1349 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.24 
 
 		 1349 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 		 2880 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.31 
 
 		 1559 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.2 
 
 		 1559 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.71 
 
 		 1372 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  38.85 
 
 		 3130 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.47 
 
 		 1337 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.67 
 
 		 2551 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 		 3676 aa  552  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 3679 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.24 
 
 		 3693 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.24 
 
 		 3693 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 		 3696 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  36.35 
 
 		 2477 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 3702 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 		 3099 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.37 
 
 		 2333 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.55 
 
 		 1909 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.09 
 
 		 2230 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 1939 aa  529  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.84 
 
 		 3424 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.82 
 
 		 3252 aa  522  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  39.69 
 
 		 3427 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.19 
 
 		 2232 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.46 
 
 		 2762 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.52 
 
 		 950 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.93 
 
 		 4080 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 1816 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.85 
 
 		 4151 aa  512  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.53 
 
 		 2136 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.01 
 
 		 1101 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 5400 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.87 
 
 		 7279 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  35.5 
 
 		 2374 aa  505  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 		 7210 aa  502  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.96 
 
 		 6889 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 2376 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 1144 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  37.02 
 
 		 1658 aa  499  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.39 
 
 		 1804 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 		 2462 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  38.56 
 
 		 2113 aa  496  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.15 
 
 		 2225 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 		 1806 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.75 
 
 		 3337 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 7110 aa  496  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  37.7 
 
 		 2985 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  37.3 
 
 		 3158 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  38.05 
 
 		 3045 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  37.24 
 
 		 1602 aa  489  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  34.69 
 
 		 1966 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 5154 aa  489  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 1805 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  36.55 
 
 		 2047 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.09 
 
 		 1126 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 1955 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 		 1909 aa  486  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 3092 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 		 3254 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.53 
 
 		 2890 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.19 
 
 		 1867 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.03 
 
 		 3930 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  37.7 
 
 		 1827 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 		 3493 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 1837 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.52 
 
 		 3099 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  39.24 
 
 		 1190 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  39.24 
 
 		 1190 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.77 
 
 		 3449 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 1190 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  34.51 
 
 		 1402 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  38.78 
 
 		 3148 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 1208 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  39.04 
 
 		 2666 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  39.06 
 
 		 3044 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  33 
 
 		 3111 aa  473  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  38.69 
 
 		 2943 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  36.69 
 
 		 1548 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  37.09 
 
 		 2544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 		 3101 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 3463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 		 1577 aa  473  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  37.09 
 
 		 2544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  35.7 
 
 		 2108 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.95 
 
 		 2126 aa  473  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 		 1828 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  37.86 
 
 		 3157 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.15 
 
 		 2277 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>