More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1238 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  58.96 
 
 
218 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  52.83 
 
 
216 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  52.58 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  50 
 
 
214 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  46.23 
 
 
219 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  43.19 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  41.43 
 
 
210 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
209 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.28 
 
 
208 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  39.5 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.05 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  35.75 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  37.32 
 
 
204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  34.17 
 
 
199 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  32.86 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  34.11 
 
 
201 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
327 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  29.91 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
348 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.17 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  28.96 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  26.92 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.46 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.89 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  27.33 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.42 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
341 aa  68.6  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
341 aa  68.2  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
329 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.26 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.36 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.82 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.11 
 
 
420 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  27.7 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
340 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
334 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.08 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.08 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.08 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.08 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.08 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  23.08 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.26 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.5 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.75 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  26.63 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  26.63 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 
310 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.04 
 
 
250 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.67 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  25.38 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.67 
 
 
269 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>