105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2858 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  100 
 
 		 289 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.28 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  42.32 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  41.3 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  41.83 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  38.77 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  32.66 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.93 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.76 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.73 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.2 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.23 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  25.44 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  33.64 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  23.4 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  33.79 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  28.83 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  49.15 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.46 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  33.6 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  25.41 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  25.4 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  22.96 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  25.86 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.17 
 
 		 204 aa  45.8  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.44 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  30.09 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  31.53 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.3 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  26.6 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  34.86 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  21.01 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.32 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  22.37 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.5 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.3 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.48 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.93 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  31.78 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.92 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  29.02 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  29.84 
 
 		 199 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  26.02 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.1 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>