More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0872 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  34.56 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  34.29 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.78 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  28.34 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  37 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  36 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.26 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 309 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  29.23 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  22.35 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.59 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.47 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.18 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.82 
 
 		 264 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  23.78 
 
 		 2112 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 		 1001 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1355  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.632641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  23.01 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.79 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 		 313 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.93 
 
 		 260 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.08 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 270 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  25 
 
 		 282 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  33.67 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 429 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32.69 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>