More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2003 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  68.6 
 
 		 242 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  66.12 
 
 		 257 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  61.98 
 
 		 242 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  59.92 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  59.67 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  60.42 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  60.42 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  65.29 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  59.92 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  56.15 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  58.26 
 
 		 283 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  58.26 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  58.26 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  55.37 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  43.62 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.67 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  46.28 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  43.03 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  46.69 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  46.28 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  43.03 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  45.64 
 
 		 292 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  44.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  44.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  44.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  44.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  44.4 
 
 		 256 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  38.27 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  28.33 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  27.08 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  26.67 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  26.67 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  26.25 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  26.25 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  32.64 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.45 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  34.45 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.38 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.84 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  28.11 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  28.5 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  35.83 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.42 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.12 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.67 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.57 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  39.25 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.55 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  32.96 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  38.32 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  38.32 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  38.32 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.89 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  37.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  37.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  37.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  37.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  37.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  34.86 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.25 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.29 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>