More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0388 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
207 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
225 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
226 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2258  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.951414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.69 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
306 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25.33 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  36.27 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  36.27 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  36.27 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  36.27 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  36.27 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  36.27 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  36.27 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.38 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.73 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
268 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.13 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  30.39 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.2 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.41 
 
 
263 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  30 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.35 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.23 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  33.63 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
400 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
400 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
269 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.6 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  27.19 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
390 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.02 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
226 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.56 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0134  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 
440 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.681884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  29.91 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 
441 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  34.59 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.44 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 
441 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.74 
 
 
335 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  26.92 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.3 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.18 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  31.03 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  32.48 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
176 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
208 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
254 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
199 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.38 
 
 
356 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
339 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  32.65 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.62 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.63 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  37.76 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.88 
 
 
414 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>