More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3351 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  66.12 
 
 
244 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  63.33 
 
 
262 aa  328  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  63.33 
 
 
262 aa  328  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  62.4 
 
 
245 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  57.94 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  59.43 
 
 
252 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  59.43 
 
 
252 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  62.92 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  58.68 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  59.5 
 
 
242 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  58.26 
 
 
242 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  57.44 
 
 
244 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  54.13 
 
 
244 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  54.55 
 
 
242 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  50 
 
 
260 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  50 
 
 
269 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  50 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
243 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.86 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 
246 aa  211  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  43.62 
 
 
246 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  45.97 
 
 
292 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  44.76 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.76 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  44.76 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  44.76 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  44.76 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  42.32 
 
 
243 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  44.35 
 
 
256 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
249 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  38.43 
 
 
246 aa  178  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
243 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  30.33 
 
 
243 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
245 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  30.49 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  28.69 
 
 
247 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  27.76 
 
 
243 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  28.69 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  28.69 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  28.69 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  27.35 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  26.94 
 
 
243 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  26.94 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  35.32 
 
 
237 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  28.71 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.42 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.7 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.54 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.54 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.07 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.07 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.54 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
634 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.77 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.37 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.05 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.64 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.78 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.14 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  41.12 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  40 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  40.19 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  40.19 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  40.19 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  39.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.58 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  39.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  39.36 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.69 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>