263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30108 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  28.47 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
204 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  28.82 
 
 
219 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  28.8 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
216 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
218 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  25.6 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
218 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  34.13 
 
 
400 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
219 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.92 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
252 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  34.13 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.17 
 
 
414 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
190 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  25.62 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.27 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.37 
 
 
215 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 
399 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.08 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.08 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
278 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 
232 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
211 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
240 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  29.23 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.51 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.19 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  23.39 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
339 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  27.05 
 
 
200 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.35 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  25 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
217 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.14 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
415 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.34 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  26.47 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  25.78 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  30.58 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.12 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  25.86 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.22 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.58 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.56 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.43 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  24.66 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00376  hypothetical protein  36.26 
 
 
293 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.985484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  24.39 
 
 
267 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  25.2 
 
 
251 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.12 
 
 
221 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.4 
 
 
205 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.33 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>