72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00376 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00376  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.985484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4986  methyltransferase type 12  88.7 
 
 		 292 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  29.23 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  34.83 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  25.56 
 
 		 245 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  37 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.14 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.95 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  36.47 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  36.26 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 240 aa  45.8  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  30.29 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.23 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.2 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  29.13 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  40.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  56.82 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.05 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  30.29 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  30.29 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  30.29 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  32.54 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  30.07 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.05 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  30.86 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  35.21 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  21.67 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.12 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.07 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  30.09 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  30.09 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  31.43 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  39.34 
 
 		 535 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 		 229 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.31 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.31 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  29.36 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>