35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6593 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  31.05 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  32.99 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  31.12 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  29.9 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  29.9 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  29.41 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  28.71 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  27.92 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  26.37 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  23.59 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  26.07 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.06 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.41 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.41 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00376  hypothetical protein  30.28 
 
 		 293 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.985484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  26.75 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  23.44 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.13 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.68 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.89 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.89 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.89 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.44 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.61 
 
 		 227 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.52 
 
 		 261 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>