103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3058 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  100 
 
 		 208 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  29.05 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  29.44 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  28.93 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  26.13 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  26.19 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  26.13 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  30.49 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  23 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  24.24 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  26.74 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  23.59 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  25.83 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  24.76 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  24.74 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  34.48 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  23.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  38.46 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 268 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.67 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.34 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  32.84 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2184  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.74 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.2 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.76 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  27.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.81 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.69 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  32.76 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.73 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.87 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  30 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  22.73 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.2 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.2 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.2 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  23.26 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.18 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 325 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.92 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 247 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.41 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.49 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  23.23 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2239  hypothetical protein  24.77 
 
 		 293 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00467151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1993  hypothetical protein  21.5 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0193266  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.58 
 
 		 390 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.74 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  32.63 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.59 
 
 		 205 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.16 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.16 
 
 		 261 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 258 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 235 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.19 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.79 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  36 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>