25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11537 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  337  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  60.74 
 
 
215 aa  200  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  62.42 
 
 
216 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  61.21 
 
 
216 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  60.26 
 
 
218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  36.81 
 
 
209 aa  85.1  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  30.72 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  32.26 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  26.06 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  29.03 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 
290 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
232 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  26.83 
 
 
207 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  37.93 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.18 
 
 
231 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  46.15 
 
 
251 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
201 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
262 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  48.57 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>