24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1292 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  29.3 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  29.3 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  28.26 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  36.81 
 
 		 166 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  34.35 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  29.25 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  27.6 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  23.81 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  25.79 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  26.67 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  25.24 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  24.53 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  23.28 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.35 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1085 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 226 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>