29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05357 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  69.15 
 
 
207 aa  305  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  45.23 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  38 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  32.99 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  31.55 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  30.73 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  28.17 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  26.74 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  26.52 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  28.16 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  28.16 
 
 
216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
203 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  27.36 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  26.2 
 
 
352 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  26.29 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  24.52 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2199  hypothetical protein  30.3 
 
 
292 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2239  hypothetical protein  29.29 
 
 
293 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00467151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2178  hypothetical protein  27.48 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2024  hypothetical protein  27.48 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2012  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
292 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0990636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
262 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.26 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  31.67 
 
 
237 aa  41.2  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1975  hypothetical protein  26.77 
 
 
306 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1993  hypothetical protein  25.4 
 
 
306 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0193266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>