19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0164 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  43.01 
 
 
195 aa  171  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  27.92 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  30.26 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  31.62 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  28.95 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  26.21 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  33.12 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  23.94 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  32.73 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  25.6 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  32.71 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  26.52 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  27.78 
 
 
210 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>