22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3310 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 		 215 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  62.68 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  62.2 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  52.45 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  60.74 
 
 		 166 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  29.74 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  32.02 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  30.57 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  22.86 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  33.12 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  24.88 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  25.76 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  23.96 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  24.52 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  23.17 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>