40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000529 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  69.15 
 
 		 204 aa  305  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  45.27 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  31.12 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  30.69 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  29.26 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  31.62 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  30.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  29.52 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  27.5 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  26.76 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.06 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0195  hypothetical protein  28.93 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0147  hypothetical protein  31.94 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  26.83 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  30.7 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  39.24 
 
 		 502 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  28.04 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  23.17 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.85 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.42 
 
 		 345 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 262 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 249 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 267 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 195 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2228  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.38 
 
 		 427 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.13 
 
 		 244 aa  41.2  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>