More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0492 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1030    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  47.23 
 
 
476 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  45.63 
 
 
476 aa  418  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  46.47 
 
 
491 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 
472 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16771  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
363 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1589  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
363 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16881  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
272 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 
410 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.95 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.88 
 
 
410 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
229 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
227 aa  94.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
420 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
411 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  26.96 
 
 
285 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
227 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
374 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
287 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
257 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
271 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  26.41 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  26.84 
 
 
309 aa  84  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
249 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  26.03 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
303 aa  77  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
238 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  30.58 
 
 
259 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
280 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
301 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
248 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
273 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  24.79 
 
 
238 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
227 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.44 
 
 
864 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.76 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.14 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  36.04 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.54 
 
 
382 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.66 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2061  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.86 
 
 
247 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.71 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.27 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.4 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  26.05 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
243 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
232 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
234 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
514 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0170  glycosyltransferase-like protein  28 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000142505  hitchhiker  7.37395e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.93 
 
 
263 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.55 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>