31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0195 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0195  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0147  hypothetical protein  89.31 
 
 
262 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  34.9 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2617  methyltransferase type 12  30.17 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  28.93 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.67 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4986  methyltransferase type 12  31.3 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  51.22 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  25.36 
 
 
6999 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  30.23 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  46 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.23 
 
 
2997 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.91 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4335  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.66 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139939  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  31.79 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  23.66 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0959  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.88 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  20.23 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  24.62 
 
 
410 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>