More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3833 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  40 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.65 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  38.37 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.34 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.85 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  21.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.2 
 
 		 309 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.43 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.39 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.56 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 349 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  30.83 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  23.87 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.95 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  35.9 
 
 		 317 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 354 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.84 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 334 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 349 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1364  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.594154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.41 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 264 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 281 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  22.4 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 		 341 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.07 
 
 		 698 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.08 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2360  (Uracil-5)-methyltransferase  38.46 
 
 		 438 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.68 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.2 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  21.71 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 		 341 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.23 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.49 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1504  (Uracil-5)-methyltransferase  37.18 
 
 		 438 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.91 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 330 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 341 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.16 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 		 335 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 341 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>