249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2839 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  60.87 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0147  hypothetical protein  36.15 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0195  hypothetical protein  34.9 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2617  methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.84 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.77 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4620  methyltransferase type 12  38.53 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.89 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.71 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.54 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 1759 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.22 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  25.67 
 
 		 1287 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 344 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.62 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  34.12 
 
 		 395 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1535  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0899  methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 422 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.65 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2324  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  34.71 
 
 		 638 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 191 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 3639 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  34.23 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 305 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  28.68 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  33.04 
 
 		 464 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.48 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.34 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.25 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.18 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 403 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 675 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  30.11 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  41.98 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 400 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  31.68 
 
 		 476 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.56 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.9 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.91 
 
 		 402 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.41 
 
 		 541 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  31.13 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.96 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  30.63 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>