More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1201 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  100 
 
 
476 aa  975    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  48.65 
 
 
491 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  47.76 
 
 
472 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  48.67 
 
 
476 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  47.23 
 
 
502 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16771  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
363 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16881  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
363 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1589  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
363 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
283 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
271 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.77 
 
 
276 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.54 
 
 
410 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
272 aa  93.6  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  31.47 
 
 
285 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
414 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
514 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
411 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  29.11 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
301 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
287 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
257 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
231 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.9 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
284 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  25.58 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
685 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
586 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
318 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
249 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
227 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.23 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  26.91 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
238 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
254 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  27.19 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.56 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.97 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  30.66 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.71 
 
 
248 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
380 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
276 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.45 
 
 
864 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  27.71 
 
 
264 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
320 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
315 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
324 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  23.83 
 
 
238 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
257 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.05 
 
 
246 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1494  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
606 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
262 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
236 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
236 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>