131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1373 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  100 
 
 		 226 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  47.51 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  42.41 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  40.53 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  46.07 
 
 		 120 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  29.65 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  22.46 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  25.63 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.41 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  26.92 
 
 		 423 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.64 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.44 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.07 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.39 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  21.74 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.38 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.38 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 430 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 		 333 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  24.55 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  29.13 
 
 		 400 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.33 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  23.12 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25.58 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  28.92 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.39 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  35.85 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  35.09 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  36.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.08 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.79 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.99 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.99 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 270 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  34 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  25.16 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.74 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  20.13 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  24.2 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  22.37 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  24.59 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  22.57 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  25.17 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  36.99 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  25.44 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.87 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  28.95 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>