248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1299 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  44.88 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  43.36 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  42.02 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  39.24 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  40.65 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  32.86 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  41.44 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.01 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  36.44 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  31.08 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.2 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.32 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.43 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.61 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.28 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.43 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.99 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.87 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.87 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.87 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  27.87 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.95 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.25 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.69 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.67 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.45 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.54 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.87 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  21.95 
 
 		 223 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  30.43 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2763  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.01 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.22 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.94 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.4 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.62 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  40.58 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.39 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  35.4 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.91 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.16 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.05 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  25 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  24.88 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.26 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.58 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.38 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  31.08 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  30.7 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  32.08 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  27.97 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1539  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.09 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  29.61 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  33.08 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.38 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  33.91 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>