72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  44.98 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  40.53 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  39.11 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  38.58 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.85 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  24.83 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  24.83 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.64 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.61 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.32 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  23.56 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02001  S-adenosyl-methyltransferase MraW  27.71 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.143743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  27.04 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  21.01 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.4 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  31.62 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  39.47 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.67 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.34 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.94 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.93 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  27.71 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.12 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.34 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1539  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.14 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.17 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  34.67 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.16 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.6 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  33.64 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  39.39 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  27.35 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  31.79 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.12 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.87 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.74 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0864  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.29 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.247156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.29 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  39.29 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.39 
 
 		 327 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.03 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  33 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3676  O-methyltransferase family 2  26.77 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  27.74 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  34.62 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  34.43 
 
 		 285 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>