125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  100 
 
 
282 aa  583  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  58.2 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  46.13 
 
 
278 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  45.19 
 
 
284 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  44.22 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  40.51 
 
 
277 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  43.21 
 
 
286 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  44.36 
 
 
269 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  38.67 
 
 
272 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  42.17 
 
 
267 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  42.69 
 
 
266 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  45.92 
 
 
266 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  43.31 
 
 
277 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  45.11 
 
 
266 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  40.64 
 
 
276 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  44.66 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  39.08 
 
 
272 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  39.61 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  39.35 
 
 
271 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  43.15 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  42.13 
 
 
266 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  40.68 
 
 
276 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  42.23 
 
 
274 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  42.46 
 
 
280 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  40.93 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  38.65 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  41.2 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  39.72 
 
 
271 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  38.2 
 
 
269 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  38.91 
 
 
277 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  38.31 
 
 
281 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  40.7 
 
 
279 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  37.64 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  40.96 
 
 
273 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  37.89 
 
 
268 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  40.32 
 
 
274 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  37.63 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  40.22 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  37.3 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  38.91 
 
 
280 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  36.15 
 
 
284 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  38.78 
 
 
278 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  40.89 
 
 
328 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  40.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  39.11 
 
 
270 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  40.93 
 
 
266 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  38.34 
 
 
323 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  38.31 
 
 
273 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  37.13 
 
 
266 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  38.11 
 
 
290 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  36.19 
 
 
270 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  41.7 
 
 
268 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  41.1 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  39.83 
 
 
262 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  37.94 
 
 
306 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  36.96 
 
 
271 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  38.78 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  36.84 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  38.22 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  38.24 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  40.15 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  38.11 
 
 
295 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  46.24 
 
 
182 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  38.17 
 
 
266 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  36.46 
 
 
268 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  38.14 
 
 
271 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  36.13 
 
 
275 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  38.65 
 
 
263 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  38.34 
 
 
268 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  39.06 
 
 
274 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  38.98 
 
 
277 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  39.57 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  35.16 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  36.88 
 
 
270 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  39.17 
 
 
275 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  38.37 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  33.83 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  39.11 
 
 
252 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  35.77 
 
 
333 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  36.79 
 
 
263 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  39.53 
 
 
271 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  37.17 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  37.72 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  33.94 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  35.07 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  36.8 
 
 
277 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  42.42 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  33.6 
 
 
234 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  37.44 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  34.21 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  33.09 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  35.8 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  33.61 
 
 
279 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  33.09 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.4 
 
 
298 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  37.02 
 
 
274 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>