92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2655 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  44.35 
 
 
251 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  40.53 
 
 
269 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  36.61 
 
 
251 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 
253 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  38.22 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  39.03 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  28.45 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
225 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  22.08 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  22.08 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.69 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  22.64 
 
 
223 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.37 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 
333 aa  52.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  27.68 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.8 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  31.68 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.28 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.46 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.54 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.28 
 
 
378 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.91 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.43 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.19 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.89 
 
 
252 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.37 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.37 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.68 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 
254 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
254 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.03 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.78 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.36 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  29.31 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.68 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.16 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  30 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.71 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.42 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.64 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  46.34 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
331 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.9 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  23.21 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  21.37 
 
 
205 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  25 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.81 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  26.36 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  27.18 
 
 
217 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.81 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  25 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  23.64 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.75 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  23.81 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  50 
 
 
228 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  22 
 
 
269 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  22 
 
 
269 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  22 
 
 
269 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  22 
 
 
269 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  22 
 
 
269 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  22.54 
 
 
226 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  23.81 
 
 
284 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>