More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2730 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  100 
 
 		 422 aa  881    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  35.17 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  27.49 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.67 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  31.82 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  30 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.88 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  34.45 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  34.45 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.88 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.88 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.1 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.1 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 246 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 250 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32.88 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.31 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.91 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  38.16 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  37.35 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.88 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.19 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.88 
 
 		 261 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.15 
 
 		 232 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.91 
 
 		 251 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.85 
 
 		 251 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.04 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 243 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  27.85 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 250 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 242 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.5 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  30.5 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.57 
 
 		 268 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.51 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  33.65 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.24 
 
 		 268 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.46 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 246 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>