173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1969 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  62.38 
 
 		 210 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  48.33 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  40.65 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  40.53 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  44.81 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  34.44 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  43.01 
 
 		 120 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  22.97 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  20.56 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  22.28 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  21.67 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  26.96 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  22.42 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.62 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  21.72 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  26.06 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  20.79 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  21.67 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.87 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.52 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  25.49 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  20.99 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.85 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.26 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.16 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  25 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  22.78 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  25.16 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.41 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.48 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  20.49 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.91 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  20 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  27.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  24.35 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  22.86 
 
 		 310 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.36 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.86 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.27 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.36 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.18 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  23.68 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  28.42 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.71 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  21.21 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  23.83 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  33.02 
 
 		 276 aa  45.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  24.44 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  22.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.42 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 337 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.28 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 299 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 270 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  20.81 
 
 		 638 aa  45.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.9 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  25.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.37 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  23.13 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.83 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  20.14 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>