259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2370 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  100 
 
 		 219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  48.33 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  50 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  43 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  47.51 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  49.06 
 
 		 120 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.15 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.4 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  32.38 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.39 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.9 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.41 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  29.63 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  33.65 
 
 		 400 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 526 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  24.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.85 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.12 
 
 		 306 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  27.98 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  29.7 
 
 		 423 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.47 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  24.34 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2169  hypothetical protein  26.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.154386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  30.69 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.03 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  32.69 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  31.65 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  25.89 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.21 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.48 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  27.21 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  21.79 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.91 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.16 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>