118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3827 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  69.8 
 
 
204 aa  287  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5107  hypothetical protein  75.62 
 
 
205 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5974  protein of unknown function DUF938  68.53 
 
 
210 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785993  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  68.16 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  68.16 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  68.16 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  68.66 
 
 
213 aa  278  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  68.66 
 
 
213 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  68.16 
 
 
213 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4677  hypothetical protein  66.83 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589564  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2517  hypothetical protein  65.2 
 
 
225 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0829  hypothetical protein  64.71 
 
 
225 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2211  hypothetical protein  67.86 
 
 
210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.610549 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2378  hypothetical protein  65.2 
 
 
225 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0419  hypothetical protein  64.71 
 
 
204 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1797  hypothetical protein  64.71 
 
 
225 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0467  hypothetical protein  64.71 
 
 
225 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0630  hypothetical protein  65.52 
 
 
225 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.729569  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8200  protein of unknown function DUF938  58.03 
 
 
211 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0344  protein of unknown function DUF938  52.74 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2380  protein of unknown function DUF938  50.69 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4757  hypothetical protein  52.43 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  52.71 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1269  protein of unknown function DUF938  54.92 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1119  hypothetical protein  55.44 
 
 
211 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1108  hypothetical protein  54.82 
 
 
210 aa  208  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.27428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2698  hypothetical protein  51.78 
 
 
261 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716681  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3089  hypothetical protein  51.49 
 
 
206 aa  201  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0147787  normal  0.0248145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0848  hypothetical protein  53.77 
 
 
298 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0135649  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1699  protein of unknown function DUF938  48 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2966  hypothetical protein  54.92 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1681  protein of unknown function DUF938  47 
 
 
210 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4540  hypothetical protein  53.33 
 
 
208 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0857  protein of unknown function DUF938  52.82 
 
 
209 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0698  hypothetical protein  48.08 
 
 
225 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27931  hypothetical protein  48.45 
 
 
214 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2435  hypothetical protein  48.26 
 
 
206 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.324043  normal  0.296066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0804  hypothetical protein  46.57 
 
 
208 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0685  protein of unknown function DUF938  53.06 
 
 
223 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2726  protein of unknown function DUF938  46.73 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  0.088544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  43.56 
 
 
205 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0088  hypothetical protein  46.89 
 
 
223 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3677  hypothetical protein  47.57 
 
 
226 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0939  hypothetical protein  50.25 
 
 
218 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420428  normal  0.161735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11201  hypothetical protein  41.06 
 
 
210 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.581749  hitchhiker  0.00640427 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1477  hypothetical protein  39.3 
 
 
207 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3991  protein of unknown function DUF938  47.74 
 
 
207 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2893  hypothetical protein  48.53 
 
 
223 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981663 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0422  SAM-dependent methyltransferase  40.58 
 
 
210 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  47.69 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4680  hypothetical protein  44.29 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121354  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15941  hypothetical protein  40.8 
 
 
207 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15781  hypothetical protein  40.8 
 
 
205 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0341  hypothetical protein  45.5 
 
 
214 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  0.537452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2021  hypothetical protein  45.08 
 
 
201 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.035685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3761  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.330518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4388  hypothetical protein  42.86 
 
 
227 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.792294  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  44.67 
 
 
228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1866  hypothetical protein  52.58 
 
 
368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5289  protein of unknown function DUF938  44.17 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  43.59 
 
 
199 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0032  hypothetical protein  44.33 
 
 
198 aa  158  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0939152  normal  0.0653958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2963  hypothetical protein  43.16 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.82842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4204  protein of unknown function DUF938  43.15 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0678  hypothetical protein  39.2 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0343452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08081  hypothetical protein  42.29 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1834  hypothetical protein  41.26 
 
 
214 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2479  protein of unknown function DUF938  37.31 
 
 
216 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0623373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1253  hypothetical protein  39.79 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0568  hypothetical protein  40.49 
 
 
216 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0140045  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2352  protein of unknown function DUF938  43.15 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0252083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1301  hypothetical protein  35.96 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0558  hypothetical protein  39.41 
 
 
217 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1783  hypothetical protein  41.55 
 
 
214 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2050  hypothetical protein  40.29 
 
 
214 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15621  hypothetical protein  39.3 
 
 
209 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2194  hypothetical protein  41.06 
 
 
214 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.645271  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0489  hypothetical protein  38.46 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0105565  normal  0.158715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03448  hypothetical protein  39.71 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44816  predicted protein  36.29 
 
 
394 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.654306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  43.15 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3018  hypothetical protein  39.09 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1025  hypothetical protein  36.55 
 
 
203 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0302942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0649  hypothetical protein  37.25 
 
 
224 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1854  hypothetical protein  39.8 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1919  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0923  hypothetical protein  38.68 
 
 
224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3247  hypothetical protein  41.21 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11626  normal  0.379736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2863  hypothetical protein  41 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.124684  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2411  hypothetical protein  38.61 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.333021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2163  hypothetical protein  39.39 
 
 
200 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.277214  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3564  Generic methyltransferase  40.7 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3826  hypothetical protein  34.34 
 
 
198 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4080  hypothetical protein  40.61 
 
 
200 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2177  hypothetical protein  38.61 
 
 
211 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1937  protein of unknown function DUF938  38.12 
 
 
215 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.798826  normal  0.970016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0911  hypothetical protein  36.14 
 
 
214 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.441859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2306  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2529  hypothetical protein  37.62 
 
 
215 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.364082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>