84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2169 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.154386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  23.72 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  23.72 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  24.55 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  28.19 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  22.22 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.71 
 
 		 390 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  28.18 
 
 		 388 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  29.25 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 264 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.76 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  28.3 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  28.8 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.25 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  29.87 
 
 		 258 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.69 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  24.39 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 476 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  22.37 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  27.87 
 
 		 287 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  22.77 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.93 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  25 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 364 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  22.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  25.3 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  24.38 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  23.86 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  22.5 
 
 		 200 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 256 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 		 268 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  23.26 
 
 		 248 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 218 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  30.84 
 
 		 248 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  21.66 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.32 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 234 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.01 
 
 		 260 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  23.89 
 
 		 258 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>