More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0190 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  33.77 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  35.19 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
194 aa  60.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.57 
 
 
263 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1520  hypothetical protein  26.88 
 
 
206 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685504  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
299 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
487 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.82 
 
 
213 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  26.7 
 
 
275 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  31.5 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
273 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32 
 
 
276 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  37.63 
 
 
212 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
237 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
250 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4081  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359937  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  28.33 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
249 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.92 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
244 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
211 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  27.5 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.95 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
208 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  26.67 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
263 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
290 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
275 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
235 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.68 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
270 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  25.93 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4739  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.673434  hitchhiker  0.00496739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.68 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
268 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
268 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
270 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  27.92 
 
 
325 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.83 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.61 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.93 
 
 
235 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1200  hypothetical protein  28.74 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 
307 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
309 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  32.26 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
248 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.57 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
1032 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  32.26 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
312 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.37 
 
 
244 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.05 
 
 
249 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  30.83 
 
 
322 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
268 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  26.67 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  39.71 
 
 
268 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  25.83 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.4 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
263 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
203 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
214 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0944  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.15 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
330 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
246 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
390 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>