170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2808 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  62.83 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  57.2 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  59.91 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  57.07 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  29.67 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  32.72 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  36.62 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  20.7 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  22.17 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  21.95 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  22.27 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  24.12 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.37 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  34.34 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.46 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.7 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  32.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  27.17 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.57 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.91 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.36 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  46.88 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  31.45 
 
 		 312 aa  48.9  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  30.52 
 
 		 226 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.38 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.47 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.49 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  30.87 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  18.85 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  40.51 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  40.96 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  36.26 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.76 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.71 
 
 		 296 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.23 
 
 		 426 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.89 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.03 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  25 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.69 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.79 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.17 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  24.47 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.17 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  25.57 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  22.63 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  32.69 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.46 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.51 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  34.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  26.35 
 
 		 704 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.46 
 
 		 426 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  33.72 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.92 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  22.14 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>