More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2494 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.92 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 208 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  31.12 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  39.58 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  36 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 1032 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.14 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  39.6 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  38 
 
 		 303 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.93 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  36.61 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.25 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.09 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  27.07 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  28.1 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  34.44 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  36.08 
 
 		 672 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  35.34 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.58 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  31.68 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.69 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  34.83 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  31.68 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  33.07 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.9 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  30.69 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  30.69 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  30.69 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  29.46 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  29.46 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  27.49 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  33.65 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.71 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33.71 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  33.71 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.61 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  30.69 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.44 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  33.71 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  36.46 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  33.71 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  33.71 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  41.43 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  34.72 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.74 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  32.63 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.76 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  31.25 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  31.25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.71 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  31.25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>