47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1982 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  58.53 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  53.75 
 
 		 310 aa  338  9e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  50.5 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  46.82 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  45.51 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0465  methyltransferase type 12  50.17 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.691055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  29.49 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  27.66 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  22.98 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  35.79 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  37.76 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  36.73 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  22.17 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  36.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  36.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  36.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  27.15 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  36.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  36.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.25 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 235 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1035  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0919  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.983812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0987  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1016  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  34.69 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.21 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 217 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  32.43 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>