More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1026 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  96.15 
 
 		 235 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  28.32 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  30.35 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  35.5 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  28.81 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  37.2 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  35.32 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.09 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  32.27 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  28.71 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  33.53 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  33.94 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  26.64 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.27 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  29.7 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  31.3 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  36.61 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.61 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.24 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.37 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  35.94 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  33.58 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.71 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.49 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  38.1 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  25.61 
 
 		 310 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.9 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.81 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  43.66 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.79 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.08 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  27.78 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 1032 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.32 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.62 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  26.35 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.06 
 
 		 347 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.02 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3549  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.43 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.82 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.23 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.56 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.01 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>