128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3712 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1262  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
232 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0509  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  normal  0.940294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.64 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  47.73 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  28.16 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  29.23 
 
 
350 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2167  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
394 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.7 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4974  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.91 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
228 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  50 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4110  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  26.32 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  29.41 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  47.73 
 
 
281 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 
261 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
264 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.83 
 
 
261 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
242 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.28 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  51.11 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  24.39 
 
 
331 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  26.92 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  41.82 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
511 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  40.98 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.86 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.81 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.69 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  31.52 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  25.81 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  28.86 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  43.9 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.48 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2181  Methyltransferase type 11  48.84 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624307  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
624 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  36.54 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  48.89 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0829  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.746498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  48.78 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1601  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.624379  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>