More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1722 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  41.48 
 
 		 402 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  40.99 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  40.97 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  34.86 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  42.03 
 
 		 214 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 213 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  43.65 
 
 		 217 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  40.93 
 
 		 217 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  42.78 
 
 		 211 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  42.08 
 
 		 218 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  35.23 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  39.34 
 
 		 216 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 215 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 219 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  38.01 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  32.63 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  40.57 
 
 		 217 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  36.05 
 
 		 229 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  33.95 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  40.57 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  41.03 
 
 		 217 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  39.02 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  40 
 
 		 207 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  36.07 
 
 		 209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  30.2 
 
 		 216 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  31.15 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 216 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  33.15 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  34.29 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  31.46 
 
 		 212 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  25.75 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.83 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.61 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 238 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  31.18 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  50 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  51.06 
 
 		 225 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 238 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 267 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.56 
 
 		 202 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 1032 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.25 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 1312 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  44.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 1476 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  50 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  51.06 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.22 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  35.35 
 
 		 658 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  53.33 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.78 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 279 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.35 
 
 		 242 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 237 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.44 
 
 		 245 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>