More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2186 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  528  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  68.55 
 
 
257 aa  359  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  62.7 
 
 
255 aa  332  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  49.4 
 
 
259 aa  255  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
256 aa  248  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  38.49 
 
 
241 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
266 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 
853 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
750 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  38.69 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
853 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
853 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
851 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
851 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
851 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
851 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  40.72 
 
 
851 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  38.37 
 
 
265 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  33.61 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  32.83 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  30.24 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.63 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  55.56 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  49.06 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
711 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
222 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
710 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  46.67 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.83 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  28 
 
 
868 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  43.84 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
284 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
242 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
242 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  48.84 
 
 
313 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
241 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
194 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  50 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  48.89 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  52.63 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  41.07 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  28.91 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.72 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  30 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  42.47 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  25.93 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  37.84 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
264 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  55.26 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  32.28 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  54.35 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  22.48 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>