83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2736 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  100 
 
 		 868 aa  1719    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 1737 aa  296  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  32.05 
 
 		 268 aa  89  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 1038 aa  77  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 257 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  29.95 
 
 		 241 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  39.81 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  36.07 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 1301 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 750 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  31.37 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  30.21 
 
 		 259 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  29.01 
 
 		 1176 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  34.81 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.76 
 
 		 851 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.76 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 1162 aa  57.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 255 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  31.3 
 
 		 591 aa  57  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  26.35 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.35 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.35 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 256 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 266 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  29.38 
 
 		 1498 aa  54.7  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 853 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 		 853 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 237 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 254 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  31.58 
 
 		 694 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 239 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  37.21 
 
 		 241 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.07 
 
 		 243 aa  52.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  27.56 
 
 		 525 aa  51.2  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  25.75 
 
 		 855 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  25.75 
 
 		 855 aa  51.2  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34.62 
 
 		 237 aa  51.2  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 241 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  25.75 
 
 		 854 aa  51.2  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  37.36 
 
 		 570 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 240 aa  50.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 244 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 243 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.59 
 
 		 558 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 243 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 243 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 2112 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  34.26 
 
 		 317 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 276 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 289 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 241 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.09 
 
 		 649 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 295 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  26.61 
 
 		 394 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 372 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  26.61 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 243 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 238 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 249 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 		 710 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  42 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 241 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  26.57 
 
 		 242 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4893  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148209  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  45.24 
 
 		 262 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 246 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 349 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30.07 
 
 		 442 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  24.55 
 
 		 706 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  28.44 
 
 		 641 aa  45.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 293 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  34.21 
 
 		 287 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 673 aa  44.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>