118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3345 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  497  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 
254 aa  175  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  39.83 
 
 
259 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  38.91 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.56 
 
 
255 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  36.1 
 
 
266 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.53 
 
 
851 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  43.33 
 
 
241 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
851 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
851 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  38.1 
 
 
851 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
851 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
853 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 
256 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.93 
 
 
853 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
853 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  35.68 
 
 
293 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
750 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  32.31 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
265 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  29.95 
 
 
868 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  27.03 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  28.46 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  43.14 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
240 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  35.23 
 
 
230 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  26.5 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
507 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  31.93 
 
 
181 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0336  hypothetical protein  29.31 
 
 
133 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.05 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.8 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0306  hypothetical protein  28.45 
 
 
133 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  26.02 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  26.83 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  26.83 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
239 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  25.83 
 
 
233 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
237 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
711 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
710 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 
345 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
401 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.23 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  44.19 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  38.78 
 
 
400 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.59 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  50 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  48.72 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
354 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  32.84 
 
 
580 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  30.36 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.97 
 
 
1124 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  28.7 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  42.11 
 
 
285 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  23.26 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  28.04 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.37 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>