103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0045 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.39 
 
 		 400 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  27.33 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.14 
 
 		 853 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  25.44 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.14 
 
 		 853 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  32.41 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  48.84 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 853 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  48.89 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.03 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  47.73 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  26.44 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.58 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 750 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 		 415 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.83 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  42 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.63 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  29.89 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  31.07 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  44.19 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  26.81 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  31.63 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  26.81 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  40.38 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1177 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2181  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1177 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  31.53 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  31.53 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  31.53 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  36.73 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 1312 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  42.59 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  23.11 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.96 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.78 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  39.62 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  23.11 
 
 		 400 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.46 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  27.38 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  30.28 
 
 		 168 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.47 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.47 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.47 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.47 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.47 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.06 
 
 		 232 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  42 
 
 		 243 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>