204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1977 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  100 
 
 		 359 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  27.81 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 		 853 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  36.94 
 
 		 868 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 		 853 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  28.71 
 
 		 268 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.79 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  31.55 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  28.4 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  26.7 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  48.08 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  51.02 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  56.25 
 
 		 240 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  46.55 
 
 		 293 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  45.1 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  28.08 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.77 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.49 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 241 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.46 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  29.01 
 
 		 241 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.59 
 
 		 764 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 246 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.47 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  48.94 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  50 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.86 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  50 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  50 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.36 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  32.17 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  47.73 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  44.68 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  45.65 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  52.27 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  45.65 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  31.15 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  40 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  40.58 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  44.9 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  40.74 
 
 		 234 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  40.74 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 197 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  51.06 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  48.89 
 
 		 244 aa  47  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 235 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 634 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 511 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1839  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>